王则夫，1991年生，教授，糖心vlog高层次引进人才，进化生态学课题组负责人（PI）。长期基于生态学理论与组学数据，对物种形成、基因组演化、进化生态学等相关领域进行研究。以第一作者（含共同）或通讯作者身份发表研究论文十余篇，先后解析了同倍体杂交物种形成的分子机制，生殖隔离在属间平行演化的遗传基础等科学问题，在研究领域内均引起了较大的反响，系列成果于近3年发表于Science、Molecular Plant、Nature Communications、The Innovation、Science Advances 等高水平期刊。
欢迎有深造意愿的本科及硕士毕业生担任科研助理；欢迎对生物信息学、进化生态学等领域感兴趣的同学推免或报考硕士及博士研究生；欢迎对相关领域感兴趣的本科生进行科研训练。我们期待热爱生活、努力工作、认真学习的你。在研究领域内，课题组与多个国内一流团队保持了良好的关系，合作密切。我们将为您提供系统的演化基因组学、生物信息学等专业技能培训，与国内一流团队的合作机会、深造及工作推荐。 【招生专业及要求】 硕士研究生：生态学学术型硕士、林业专硕；本科毕业专业不限，需对编程等生物信息学技能感兴趣； 博士研究生：生态学博士；硕士期间拥有生物信息学相关分析经验或基础。
教育经历： 2009.08 - 2013.06 兰州大学 生命科学学院 生物学基地班 学士 2013.09 - 2016.06 兰州大学 生命科学学院 生态学专业 硕士（导师：刘建全教授） 2016.09 - 2019.12 四川大学 生命科学学院 保护生物学专业 博士（导师：刘建全教授）
工作经历： 2020.04 - 2022.10 四川大学 生命科学学院 生态学系 科研助理 2022.12 - 至 今 糖心vlog 糖心vlog 生态学系 教授
学术兼职： 受邀担任Journal of Systematics and Evolution、BMC Genomics、BMC Plant Biology、Plant Diversity、Frontiers in Plant Science、Integrative Zoology和Mitochondrial DNA Part B-Resources 等SCI期刊匿名审稿人。
科研项目：
国家自然科学基金，青年项目，2024-01-01 至 2026-12-31，30万元，在研，主持 江苏省自然科学基金，青年基金，2023-07-01 至 2026-06-60，20万元，在研，主持 糖心vlog标志性成果培育项目，2023-05-01 至 2026-04-30，30万元，在研，主持 糖心vlog高层次人才引进启动经费，2023，100万元，在研，主持 国家自然科学基金委员会，重点项目，32030006，拟南芥西藏生态型的适应性演化研究，2021-01-01 至 2025-12-31，295万元，在研，参与 国家自然科学基金委员会，面上项目，32271692，青藏高原高寒草甸挥发性有机物排放对放牧强度的响应，2023-01-01 至 2026-12-31，54万元，在研，参与
国家自然科学基金委员会，面上项目，32270302，拟南芥四川生态型抗水淹胁迫主效基因位点的分子作用机制研究，2023-01-01 至 2026-12-31，55万元，在研，参与
国家自然科学基金委员会，面上项目，32170221，獐牙菜亚族的系统发育转录组学研究，2022-01-01 至 2025-12-31，58万元，在研，参与
国家自然科学基金委员会，面上项目，31770566，虎耳草属物种多样化的宏观进化格局研究，2018-01-01 至 2021-12-31，62万元，结题，参与
科研成果：
（# 共同一作，* 通讯作者，下同）
代表性论文：
1. Zefu Wang #, Yuanzhong Jiang #, Hao Bi #, Zhiqiang Lu #, … , Quanjun Hu *, Richard J. Abbott *, Jianquan Liu *. (2021). Hybrid speciation via inheritance of alternate alleles of parental isolating genes. Molecular Plant. 14: 208–222. (【代表作1】，IF2021=21.949，生物学一区，封面文章，ESI高被引) 该研究以桦木科虎榛子属（Ostryopsis）物种为研究对象，通过长达8年的同质园实验、体内及体外生理实验、基因组分析（de novo基因组测序、全基因组重测序、突变速率评估、群体遗传学分析、杂交重组分析等）、体外酶活实验、拟南芥转基因实验等，首次实现对于杂交物种形成基因（HHS基因）的定位，揭示了杂交物种形成的分子遗传新机制：亲本种间具有不同的生殖隔离性状，其杂交后代通过分别继承来自不同亲本种的生殖隔离性状相关基因（等位基因），使得亲本种间不同的生殖隔离性状在杂交后代中发生了重新组合，并最终促使其成为新的杂交物种。匿名审稿阶段，几位匿名审稿人不约而同的对该研究做出了极高的评价，认为作为迄今为止最为系统的杂交物种形成研究，该研究提出的鉴定杂交物种形成的新方法将成为相关研究领域的“金标准”（gold standard）。该研究最终作为封面文章发表于2021年2月期Molecular Plant，该期刊同期刊发Spotlight文章对该研究进行了亮点评论。该研究一经发表，便引起了广泛关注，《中国科学报》等媒体及公众号对该研究进行了采访与报道。迄今为止，该研究所提出的理论与方法已应用于众多动植物物种之中。
2. Hong Wu #, Zefu Wang #, Yuxing Zhang #, … , Jianquan Liu *, Li Yu *. (2023). Hybrid origin of a primate, the gray snub-nosed monkey. Science. 380: eabl4997. (【代表作2】，共同一作，IF2022=56.9，综合性一区) 该研究基于 【代表作1】 所提出的新理论与新方法，对金丝猴（仰鼻猴属，Rhinopithecus）的起源历史进行了研究。基因组分析表明，黔金丝猴可能是同倍体杂交物种，其亲本种分别是川金丝猴以及滇金丝猴/怒江金丝猴的祖先种。杂交起源事件可能导致了黔金丝猴“马赛克式”的毛色性状，本研究利用 【代表作1】 所提出的研究杂交物种形成的新方法，鉴定到了一些可能与杂交起源事件导致的毛色性状相关的候选基因，并利用分子实验对其功能分化进行了体外验证。这是首次在灵长类动物中发现杂交起源现象，揭示了杂交起源事件在灵长类表型多样化过程中的重要作用。
3. Zefu Wang #, Minghui Kang #, … , Jianquan Liu *. (2022). Genomic evidence for homoploid hybrid speciation between ancestors of two different genera. Nature Communications. 13: 1987. (【代表作3】，IF2021=17.694，综合性一区) 该研究以桦木科鹅耳枥属（Carpinus）与铁木属（Ostrya）物种为研究材料，发现鹅耳枥属千金榆组物种可能同倍体杂交起源于鹅耳枥属鹅耳枥组物种与铁木属物种。这是首次在高级分类单元（属间）发现同倍体杂交物种形成事件，也是迄今为止报道的最古老的（17-33 Ma）同倍体杂交物种形成事件，揭示了杂交物种形成事件对于物种多样性以及高级分类单元网状系统发育关系的重要作用。该研究作为 【代表作1】 的延伸，所提出的分析方法将有助于科研人员对古老的杂交物种形成事件进行研究。 4. Zefu Wang #, Yuanzhong Jiang #, Xiaoyue Yang #, … , Jianquan Liu *. (2022). Molecular signatures of parallel adaptive divergence causing reproductive isolation and speciation across two genera. The Innovation. 3: 100247. (【代表作4】，高水平国产新刊，IF2022=32.1) 该研究以 【代表作3】 中鹅耳枥属（Carpinus）的千金榆/川黔千金榆与 【代表作1】 中虎榛子属（Ostryopsis）的虎榛子/滇虎榛子为研究对象，发现来自不同属的两组物种对，在不同时间尺度上受到相似环境（土壤和温度）的自然选择作用，在生境适应性和花期等相关基因上发生了平行的遗传演化和生殖隔离，最终导致了相似的物种形成过程及遗传机制。此过程中的自然选择并非作用于个别基因，而是作用于整个调控通路。这是首次在属间发现生殖隔离的平行演化及其分子证据，为达尔文“自然选择导致物种起源”理论提供了重要支持。该研究的方法适用于其它生境存在相似差异的不同物种对间，可用于鉴定它们物种形成过程中的相关基因和生殖隔离平行演化的分子机制。 5. Baolin Zhang #, Wu Chen #, Zefu Wang #, … , Yongtang Zheng *, Guojie Zhang *, Dongdong Wu *. (2023). Comparative genomics reveal hybrid origin of a macaque group. Science Advances. 9: eadd3580. (【代表作5】，共同一作，IF2022=13.6) 该研究基于 【代表作1】 所提出的新理论与新方法，对猕猴属（Macaca）物种的杂交起源历史进行了研究。通过对12个猕猴属物种进行基因组分析，发现其中fascicularis组物种的祖先种可能同倍体杂交起源于sinica组的祖先种和silenus组的祖先种。在fascicularis组物种中，一些生殖隔离相关基因可能分别继承自两个亲本组，并因此导致了fascicularis组物种的表型也分别继承自两个亲本组。
第一作者（含共同）及通讯作者论文：
6. Zefu Wang #, Xiao Zhang #, … , Shengdan Wu *, Bingbing Liu *, Dafu Ru *. (2023). Chromosome-level genome assembly and population genomics of Robinia pseudoacacia reveal the genetic basis for its wide cultivation. Communications Biology. 6: 797. (IF2022=5.9，生物学二区)
7. Zefu Wang #, Tao Ma #, … , Qiang Qiu *. (2015). Convergent evolution of SOCS4 between yak and Tibetan antelope in response to high-altitude stress. Gene. 572: 298–302. (IF2015=2.319) 8. Xiaoyue Yang #, Zefu Wang #, … , Guangpeng Ren *. (2019). Plastomes of Betulaceae and phylogenetic implications. Journal of Systematics and Evolution. 57: 508–518. (共同一作，IF2019=2.779，生物学一区) 9. Weixiao Lei #, Zefu Wang #, Man Cao #, … , Bingbing Liu *, Dafu Ru *. (2022). Chromosome-level genome assembly and characterization of Sophora Japonica. DNA Research. 29: dsac009. (共同一作，IF2021=4.477，生物学二区) 10. Xiaoyue Yang #, Zefu Wang #, … , Yongzhi Yang *. (2020). A chromosome-level reference genome of the hornbeam, Carpinus fangiana. Scientific Data. 7: 24. (共同一作，IF2020=6.444，综合性二区) 11. Zefu Wang, Xingxing Mao, … , Lushui Zhang *. (2018). The complete chloroplast genome of Pterospermum kingtungense, a Critically Endangered species. Mitochondrial DNA Part B-Resources. 3: 1167–1168. (IF2018=0.561) 12. Lushui Zhang, Xingxing Mao, … , Zefu Wang *. (2021). The complete chloroplast genome of Torreya parvifolia, a species with extremely small population in China. Mitochondrial DNA Part B-Resources. 6: 387–388. (通讯作者，IF2021=0.610) 13. Xiaoyue Yang, Xiyou Qian, Zefu Wang *. (2019). The complete chloroplast genome of Casuarina glauca. Mitochondrial DNA Part B-Resources. 4: 357–358. (通讯作者，IF2018=0.885) 14. Xiaoyue Yang, Xiyou Qian, Zefu Wang *. (2018). The complete chloroplast genome of Mimosa pudica and the phylogenetic analysis of mimosoid species. Mitochondrial DNA Part B-Resources. 3: 1265–1266. (通讯作者，IF2018=0.561) 15. Lushui Zhang, Xiaoyue Yang, … , Zefu Wang *. (2018). The complete chloroplast genome of Antiaris toxicaria, a medicinal and extremely toxic species. Mitochondrial DNA Part B-Resources. 3: 1100–1101. (通讯作者，IF2018=0.561)
部分合作论文：
16. Chunlin Chen #, Brad R. Ruhfel #, Jialiang Li, Zefu Wang, … , Xiaoting Xu *, Zhenxiang Xi *, Jianquan Liu *. (2023). Phylotranscriptomics of Swertiinae (Gentianaceae) reveals that key floral traits are not phylogenetically correlated. Journal of Integrative Plant Biology. 6: 1490–1504. (IF2022=11.4，生物学一区，4/15)
17. Shengdan Wu #, Yi Wang #, Zefu Wang, Nawal Shrestha, Jianquan Liu *. (2022). Species divergence with gene flow and hybrid speciation on the Qinghai–Tibet Plateau. New Phytologist. 234: 392–404. (IF2021=10.323，生物学一区，3/5) 18. Mingjia Zhu, Zhenyue Wang, Yongzhi Yang, Zefu Wang, Wenjie Mu, Jianquan Liu *. (2022). Multi-omics reveal differentiation and maintenance of dimorphic flowers in an alpine plant on the Qinghai-Tibet Plateau. Molecular Ecology. 32: 1411–1424. (IF2022=4.9，生物学一区，4/6) 19. Yongzhi Yang #, Tao Ma #, Zefu Wang, … , Jianquan Liu *. (2018). Genomic effects of population collapse in a critically endangered ironwood tree Ostrya rehderiana. Nature Communications. 9: 5449. (IF2018=11.878，综合性一区，3/10) 20. Qiang Qiu #, Lizhong Wang #, Kun Wang #, Yongzhi Yang #, … , Zefu Wang, … , Jianquan Liu *. (2015). Yak whole-genome resequencing reveals domestication signatures and prehistoric population expansions. Nature Communications. 6: 10283. (IF2015=11.329，综合性一区，6/13) 21. Xiaogang Dai #, Quanjun Hu #, Qingle Cai #, Kai Feng #, Ning Ye #, Gerald A Tuskan #, … , Zefu Wang, … , Jun Wang *, Jianquan Liu *, Tongming Yin *. (2014). The willow genome and divergent evolution from poplar after the common genome duplication. Cell Research. 24: 1274–1277. (IF2014=12.413，生物学一区，10/17) 22. Xuchen Yang #, Minghui Kang #, Yanting Yang #, … , Zefu Wang, … , Zhenxiang Xi *. (2019). A chromosome-level genome assembly of the Chinese tupelo Nyssa sinensis. Scientific Data. 6: 282. (IF2019=5.929，综合性二区，7/11)
|
